Domky z kontejnerů ve dvou patrech využívají vertikální uspořádání k maximálnímu využití životního prostoru na kompaktní půdorysné ploše. Koncept obvykle umisťuje společenské prostory (kuchyň, obývací pokoj) do přízemí a soukromé prostory (ložnice, koupelny) do horního podlaží, které jsou spojeny vnitřním nebo vnějším schodištěm. Stabilitu zajišťuje stavební inženýrské řešení s vyztuženými spoji mezi kontejnery a případnými dodatečnými ocelovými podporami. Spodní úroveň často využívá betonové základy nebo pilíře, které zvyšují konstrukci pro ochranu proti povodním nebo z estetických důvodů. Velká okna a skleněné dveře na obou podlažích zajišťují optickou propojenost mezi jednotlivými podlažími i s vnějším prostředím. Terasy nebo balkony v horním podlaží rozšiřují životní prostory směrem ven. Některé konstrukce využívají konzolového vyložení horních kontejnerů k vytvoření zastřešených venkovních prostor dole. Vertikální uspořádání umožňuje zajímavé vnitřní objemy, například prostory s dvojitou výškou nebo mezanin. Vnější úpravy mohou mezi podlažími rozlišovat – například průmyslový kovový materiál dole a dřevěné obložení nahoře. Tyto domky vykazují vynikající tepelné vlastnosti, protože teplo se přirozeně šíří z dolních na horní podlaží. Zvláštní pozornost je věnována návrhu schodiště a umístění oken, aby byla zajištěna pohodlná cirkulace vzduchu a bohaté denní osvětlení v obou podlažích. Vertikální konfigurace se osvědčuje zejména na městských parcích nebo v krajině, kde je důležité maximálně využít výhledy.