บ้านคอนเทนเนอร์สองชั้นใช้พื้นที่ใช้สอยอย่างคุ้มค่าบนพื้นที่จำกัดด้วยการซ้อนแนวตั้ง โดยทั่วไปการออกแบบจะวางพื้นที่ใช้สอยรวม (ห้องครัว ห้องนั่งเล่น) ไว้ที่ชั้นล่าง และพื้นที่ส่วนตัว (ห้องนอน ห้องน้ำ) ไว้ชั้นบน โดยเชื่อมต่อกันด้วยบันไดภายในหรือภายนอก การออกแบบโครงสร้างทางวิศวกรรมรับประกันความมั่นคง โดยมีจุดเชื่อมต่อที่เสริมความแข็งแรงระหว่างคอนเทนเนอร์และเหล็กยึดเสริมตามความจำเป็น มักมีฐานปูนหรือเสาเข็มที่ยกพื้นให้สูงขึ้นเพื่อป้องกันน้ำท่วมหรือเพิ่มความสวยงามให้กับชั้นล่าง หน้าต่างขนาดใหญ่และประตูกระจกทั้งสองชั้นช่วยรักษาการมองเห็นที่ต่อเนื่องกันระหว่างชั้นและเชื่อมโยงกับสภาพแวดล้อมภายนอก ระเบียงหรือชานบ้านชั้นสองยื่นออกไปเพื่อขยายพื้นที่ใช้สอยสู่ด้านนอก แบบบ้านบางแบบออกแบบให้คอนเทนเนอร์ชั้นบนยื่นออกมาเพื่อสร้างพื้นที่ด้านล่างที่มีหลังคาคลุม การจัดเรียงในแนวตั้งเปิดโอกาสให้เกิดปริมาตรภายในที่น่าสนใจ พร้อมศักยภาพสำหรับพื้นที่สูงสองชั้นหรือชั้นลอย การตกแต่งภายนอกอาจมีความแตกต่างกันระหว่างชั้น เช่น ใช้วัสดุโลหะสไตล์อุตสาหกรรมที่ชั้นล่างและไม้ที่ชั้นบน บ้านประเภทนี้มีสมรรถนะทางความร้อนที่ยอดเยี่ยม เนื่องจากความร้อนสามารถลอยขึ้นสู่ชั้นบนได้อย่างเป็นธรรมชาติ การใส่ใจอย่างรอบคอบต่อการออกแบบบันไดและการวางตำแหน่งหน้าต่างช่วยให้มั่นใจได้ถึงการไหลเวียนอากาศที่สะดวกและแสงสว่างธรรมชาติที่เพียงพอตลอดทั้งสองชั้น การจัดวางในลักษณะแนวตั้งนี้มีประโยชน์อย่างยิ่งสำหรับที่ดินในเมืองหรือจุดชมวิวที่ต้องการใช้ประโยชน์จากทัศนียภาพให้ได้มากที่สุด