Дворівневі контейнерні будинки максимізують житловий простір на компактних площах за рахунок вертикального зростання. Зазвичай дизайн передбачає розташування загальних зон (кухня, вітальня) на першому поверсі, а приватних (спальні, ванні кімнати) — на другому, які з'єднуються внутрішніми або зовнішніми сходами. Інженерні рішення забезпечують стабільність конструкції, посилені з'єднання між контейнерами та додаткові сталеві підтримки за потреби. Нижній рівень часто має бетонні фундаменти або опори, які піднімають будинок для захисту від повені або естетичного ефекту. Великі вікна та скляні двері на обох рівнях зберігають візуальну зв'язність між поверхами та зовнішнім середовищем. Балкони або тераси другого поверху розширюють житловий простір назовні. Деякі проекти передбачають виступаючі верхні контейнери, щоб створити навісні зони на нижньому рівні. Вертикальне розташування дозволяє створювати цікаві внутрішні об'єми, включаючи двоповерхові простори або мезоніни. Оздоблення фасаду може відрізнятися на різних рівнях — наприклад, промислова металева обробка внизу та дерев'яна облицювання зверху. Ці будинки демонструють чудливі теплові характеристики, адже тепле повітря природним чином піднімається з одного рівня на інший. Уважне ставлення до дизайну сходів та розташування вікон забезпечує комфортну циркуляцію повітря та багато природного світла на обох поверхах. Вертикальна конфігурація особливо корисна для міських ділянок або мальовничих місць, де важливо максимізувати оглядовість.