Domovy z dvoch podlaží kontajnerov maximalizujú životný priestor na kompaktných plochách vďaka vertikálnemu usporiadaniu. Toto usporiadanie zvyčajne umiestňuje spoločenské priestory (kuchyňa, obývačka) na prízemí a súkromné priestory (spálne, kúpeľne) v poschodí, ktoré sú prepojené vnútornými alebo vonkajšími schodiskami. Stavebné inžinierstvo zabezpečuje stabilitu, pričom sú medzi kontajnermi použité vystužené spoje a v prípade potreby aj dodatočné oceľové podpery. Spodná úroveň často využíva betónové základy alebo pilierové podpery, ktoré štruktúru dvíhajú, čím sa dosiahne ochrana pred povodňami alebo estetický efekt. Veľké okná a sklenené dvere na oboch podlažiach udržiavajú vizuálnu prepojenosť medzi jednotlivými podlažiami a vonkajším priestorom. Terasy alebo balkóny v druhom poschodí rozširujú životný priestor smerom von. Niektoré návrhy využívajú konzolové vyloženie horných kontajnerov, čím vytvárajú kryté vonkajšie priestory v spodnej časti. Vertikálne usporiadanie umožňuje zaujímavé interiérové objemy, napríklad priestory s dvojitou výškou alebo mezaníny. Vonkajšie úpravy môžu medzi podlažiami vytvárať rozdiely – napríklad priemyselný kov na spodku a drevené obloženie v hornej časti. Tieto domy vykazujú vynikajúce tepelné vlastnosti, keďže teplo sa prirodzene šíri cez jednotlivé podlažia. Dôkladná pozornosť pri návrhu schodiska a umiestnení okien zabezpečuje pohodelnú cirkuláciu a bohaté množstvo denného svetla v oboch podlažiach. Toto vertikálne usporiadanie sa špeciálne osvedčuje na mestských pozemkoch alebo v krajinkách, kde je priorita maximalizovať výhľad.