Domy kontenerowe o dwóch kondygnacjach maksymalizują powierzchnię użytkową na niewielkich działkach dzięki pionowemu ustawieniu. Projekt zazwyczaj przewiduje umieszczenie stref wspólnych (kuchnia, salon) na parterze, a przestrzeni prywatnych (sypialnie, łazienki) na piętrze, połączonych schodami wewnętrznymi lub zewnętrznymi. Inżynieria konstrukcyjna zapewnia stabilność, z wzmocnionymi połączeniami między kontenerami oraz dodatkowymi podporami stalowymi w razie potrzeby. Poziom dolny często posiada fundamenty betonowe lub filary, które podnoszą konstrukcję w celu ochrony przed powodzią lub uzyskania lepszego efektu estetycznego. Duże okna i drzwi szklane na obu poziomach pozwalają zachować wizualną ciągłość między piętrami oraz z otoczeniem. Tarasy lub balkony na drugim piętrze rozszerzają przestrzeń życiową na zewnątrz. Niektóre projekty obejmują wychylenie (konsolę) górnych kontenerów, tworząc zadaszone strefy zewnętrzne na dole. Ustawienie pionowe umożliwia ciekawe rozwiązania przestrzeni wewnętrznych, np. pomieszczenia o podwójnej wysokości lub poziomy mezaninowe. Wykończenie elewacji może się różnić na poszczególnych piętrach – na przykład przemysłowy metal na dole i drewniana obrobka na górze. Domy te charakteryzują się doskonałą izolacją termiczną, ponieważ ciepło naturalnie unosi się przez kondygnacje. Szczególna uwaga poświęcona jest projektowaniu schodów i rozmieszczeniu okien, aby zapewnić komfortową cyrkulację powietrza i obfitość światła dziennego na obu poziomach. Konfiguracja pionowa szczególnie przydatna jest na działkach miejskich lub w miejscach o pięknych widokach, gdzie kluczowe jest ich maksymalne wykorzystanie.