Двухэтажные дома из контейнеров максимально используют жилое пространство на компактных площадях за счет вертикального расположения. Обычно проект предполагает размещение общих зон (кухня, гостиная) на первом этаже, а приватных помещений (спальни, ванные комнаты) — на втором, с лестницами (внутренними или внешними), соединяющими уровни. Инженерные расчеты обеспечивают устойчивость конструкции, включая усиленные соединения между контейнерами и дополнительные стальные опоры при необходимости. Нижний уровень часто устанавливается на бетонный фундамент или сваи, что позволяет приподнять строение для защиты от наводнений или улучшения эстетики. Большие окна и панорамные двери на обоих этажах обеспечивают визуальную связь между уровнями и окружающей средой. Балконы или террасы второго этажа расширяют жилое пространство наружу. Некоторые проекты предусматривают вынос верхних контейнеров вперед, создавая навесы на нижнем уровне. Вертикальная компоновка позволяет создавать интересные объемы внутри — например, помещения с двойной высотой или промежуточные этажи (мезонины). Отделка фасада может отличаться на разных уровнях — например, нижняя часть выполняется из промышленного металла, а верхняя — облицовывается деревом. Такие дома обладают отличными теплоизоляционными свойствами, поскольку тепло естественным образом поднимается с нижнего уровня на верхний. Особое внимание уделяется проектированию лестниц и размещению окон, чтобы обеспечить комфортную циркуляцию воздуха и достаточное количество естественного света на обоих этажах. Вертикальная конструкция особенно актуальна для городских участков или живописных местностей, где важна максимальная обзорность.